绍兴市疾病预防控制中心前身为始建于一九六四年十二月的绍兴市卫生防疫站，是全市疾病预防与控制、应急预警与处理、疫情收集与报告、监测检验与评价、健康教育与促进、应用研究与指导、技术管理与服务的业务指导中心。承担传染病、慢性非传染性疾病的预防控制、各种重大传染病暴发与公共卫生突发事故的处理、儿童免疫规划和预防接种、职业卫生与中毒控制，卫生监测检验、公共卫生服务、检测与评价、健康教育和健康促进、政策评价与疾病预防策略及措施的推广应用等疾病预防控制工作。中心设立4个职能科室和11个业务科室。另对外挂牌有“绍兴市健康教育所”、“绍兴市心脑血管防治办公室”、“绍兴市HIV确诊实验室”，并设有流行病学市级重点学科。中心是绍兴市委、市政府授牌的市级文明单位。通过了实验室计量认证，职业病卫生技术服务资质、职业病体检与诊断机构资质和档案管理省级认定。

中心目前拥有各类专业技术人员79名，其中高级职称22名，中级职称20名，初级职称31名。

疾控大楼面积16465平方米，其中实验室4450平方米、职业病房2000余平方米。现拥有色谱-质谱联用仪、原子吸收分光光度计、气相色谱和高效液相色谱分析仪等精密仪器设备。

中心始终认真贯彻“预防为主”的方针，以“和谐、务实、进取、创新”的精神，内强素质、外树形象，为构建和谐社会保驾护航。